Nautilus нужен для тех случаев, когда файловая навигация должна быть визуальной: перетаскивание, просмотр папок и работа с desktop-интеграцией. Для быстрых операций в окружении остаётся Yazi.
Когда нужен GUI
Предпросмотр изображений, подключённые устройства, drag-and-drop и системный диалог выбора файла проще воспринимать визуально. В этих сценариях попытка сделать всё из терминала только добавляет команды.
По имени файлы быстрее находит fd, по содержимому — ripgrep. Nautilus остаётся обзором и точкой взаимодействия с desktop. Это следует правилу из принципов дизайна: интерфейс выбирается под задачу, а не из верности одному инструменту.